Краткое содержание

arXiv:2511.12805v1 Тип анонса: cross Аннотация: Оценка причинно-следственных сетей по биологическим данным является ключевым этапом в системной биологии. При проверке выведенной сети оценка на основе эффектов вмешательства особенно важна для последующих вероятностных рассуждений и идентификации потенциальных мишеней для лекарственных препаратов. В контексте вывода регуляторных сетей генов в качестве эталонных источников часто используются биологические базы данных. Эти базы данных обычно описывают связи качественным, а не количественным образом. Однако было разработано мало метрик оценки, которые учитывают эту качественную природу. Чтобы решить эту проблему, мы разработали метрику — знаково-дополненную структурную интервенционную дистанцию (sSID), а также взвешенную sSID, которая включает в себя чистые эффекты вмешательства. С помощью моделирования и анализа реальных транскриптомных наборов данных мы обнаружили, что предложенные нами метрики могут определить иной алгоритм как оптимальный по сравнению с обы